空气净化呼吸器的外层往往积聚着很多外界空气中的灰尘、等污物，而里层阻挡着呼出的、唾液，因此，两面不能交替使用，否则会将外层沾染的污物在直接紧贴面部时吸入人体，而成为传染源。口罩在不戴时，应叠好放入清洁的信封内，并将紧贴口鼻的一面向里折好，切忌随便塞进口袋里或是在脖子上挂着。
若空气净化呼吸器被呼出的热气或唾液弄湿，其阻隔病菌的作用就会大大降低。所以，平时多备几只口罩，以便替换使用，应每日换洗一次。洗涤时应先用开水烫5分钟。
空气净化呼吸器应该坚持每天清洗和，不论是纱布口罩还是空气过滤面罩都可以用加热的办法进行。具体做法是：
1.清洗。先用温水和肥皂轻轻地揉搓纱布口罩，碗形面罩可以用软刷蘸洗涤剂轻轻刷净，然后用清水洗干净。请注意，千万不要用力揉搓，因为如果纱布的经纬间隙过大就失去了防阻飞沫的作用。
2.。将洗干净的口罩放在2%的过氧乙酸溶液中浸泡30分钟或在开水里煮20分钟或放在蒸锅里蒸15分钟，然后晾干备用。这种方法适用于纱布口罩和碗形面罩。
3.检查。再次使用前，应该仔细检查口罩和面罩是否仍然完好，对于纱布口罩和面罩都可以采取透光检查法，即拿到灯前照看，看看有没有明显的光点，中间部分与边缘部分透光率是不是一致，如果有疑问就要更换新的。不论怎样，面罩和口罩在清洗3至7次以后一般就要更新，质量特别好的口罩可以清洗10次。活性炭吸附式口罩要注意定期更换活性炭夹层，如果活性炭夹层是不可更换的，用过7至14天就要更换，这种口罩是不能清洗后再重复使用的。